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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4axzA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: putative antigen p35; | PDBTitle: borrelia burgdorferi outer surface lipoprotein bba73 |
Added to library: Sat May 11 08:21:43 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | E | K | E | K | I | I | K | K | I | A | Q | E | F | D | E | N | E | K | L | I | N | K | I | G | P | N | I | E | M | F | A | Q | T | I | N | T | D | I | Q | K | I | E | P | N | D | Q | F | G | I | N | K | T | L | F | T | E | K | K | D | N | N | I | D | F | M | L | K | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | R | R | L | F | Y | S | S | L | N | Y | D | E | N | K | I | K | K | L | A | T | I | L | A | Q | T | S | S | S | N | D | Y | H | Y | T | L | I | G | L | I | F | W | T | G | F | K | I | Q | E | A | F | E | S | A | V | N | I | L | T | K | D | E | Q | K | R | L | I | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | R | T | K | T | V | K | E | I | Q | E | N | F | E | K | L | M | Q | E | R | N | S | W | I | K | I | V | D | N | I | I | G | E | Y | D | K | N | T | G | G | C | K | A | D | G | K | I | L | G | E | V | I | R | V | G | Y | E | H | E | L | D | S | N | K | S | M | Q | I | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | I | E | T | P | L | K | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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