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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4avmA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: bridging integrator 2; | PDBTitle: crystal structure of the n-bar domain of human bridging2 integrator 2. |
Added to library: Sat Jun 23 13:13:19 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | Q | V | Q | K | K | F | S | R | A | Q | E | K | V | L | Q | K | L | G | K | A | V | E | T | K | D | E | R | F | E | Q | S | A | S | N | F | Y | Q | Q | Q | A | E | G | H | K | L | Y | K | D | L | K | N | F | L | S | A | V | K | V | M | H | E | S | S | K | R | V | S | E | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | Q | E | I | Y | S | S | E | W | D | G | H | E | E | L | K | A | I | V | W | N | N | D | L | L | W | E | D | Y | E | E | K | L | A | D | Q | A | V | R | T | M | E | I | Y | V | A | Q | F | S | E | I | K | E | R | I | A | K | R | G | R | K | L | V | D | Y | D | S | A | R | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | L | E | A | V | Q | N | A | K | K | K | D | E | A | K | T | A | K | A | E | E | E | F | N | K | A | Q | T | V | F | E | D | L | N | Q | E | L | L | E | E | L | P | I | L | Y | N | S | R | I | G | C | Y | V | T | I | F | Q | N | I | S | N | L | R | D | V | F | Y | R | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | K | L | N | H | N | L | Y | E | V | M | S | K | L | E | K | Q | H | S | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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