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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4arnD_ | PDB header: immune system | Chain: D: PDB Molecule: toll receptor, variable lymphocyte receptor b.61 chimera; | PDBTitle: crystal structure of the n-terminal domain of drosophila toll2 receptor |
Added to library: Fri Feb 1 12:11:40 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | F | G | R | D | A | C | S | E | M | S | I | D | G | L | C | Q | C | A | P | I | M | S | E | Y | E | I | I | C | P | A | N | A | E | N | P | T | F | R | L | T | I | Q | P | K | D | Y | V | Q | I | M | C | N | L | T | D | T | T | D | Y | Q | Q | L | P | K | K | L | R | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | V | D | R | V | Q | M | R | R | C | M | L | P | G | H | T | P | I | A | S | I | L | D | Y | L | G | I | V | S | P | T | T | L | I | F | E | S | D | N | L | G | M | N | I | T | R | Q | H | L | D | R | L | H | G | L | K | R | F | R | F | T | T | R | R | L | T | H | I | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | L | T | D | M | R | N | L | S | H | L | E | L | R | A | N | I | E | E | M | P | S | H | L | F | D | D | L | E | N | L | E | S | I | E | F | G | S | N | K | L | R | Q | M | P | R | G | I | F | G | K | M | P | K | L | K | Q | L | N | L | A | S | N | Q | L | K | S | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | D | G | I | F | D | R | L | T | S | L | Q | K | I | W | L | H | T | N | P | W | D | C | S | C | P | R | I | D | Y | L | S | R | W | L | N | K | N | S | Q | K | E | Q | G | S | A | K | C | S | G | S | G | K | P | V | R | S | I | I | C | P | T | T | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | B | T | T | T | B | G | G | G |
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