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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4apfB_ | PDB header: cell cycle | Chain: B: PDB Molecule: cullin 3; | PDBTitle: crystal structure of the human klhl11-cul3 complex at 3.1a2 resolution |
Added to library: Sat May 12 11:37:34 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | E | K | Y | V | N | S | I | W | D | L | L | K | N | A | I | Q | E | I | Q | R | K | N | N | S | G | L | S | F | E | E | L | Y | R | N | A | Y | T | M | V | L | H | K | H | G | E | K | L | Y | T | G | L | R | E | V | V | T | E | H | L | I | N | K | V | R | E | D | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | S | L | N | N | N | F | L | Q | T | L | N | Q | A | W | N | D | H | Q | T | A | M | V | M | I | R | D | I | L | M | Y | M | D | R | V | Y | V | Q | Q | N | N | V | E | N | V | Y | N | L | G | L | I | I | F | R | D | Q | V | V | R | Y | G | C | I | R | D | H | L | R | Q | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | D | M | I | A | R | E | R | K | G | E | V | V | D | R | G | A | I | R | N | A | C | Q | M | L | M | I | L | G | L | E | G | R | S | V | Y | E | E | D | F | E | A | P | F | L | E | M | S | A | E | F | F | Q | M | E | S | Q | K | F | L | A | E | N | S | A | S | V | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | K | V | E | A | R | I | N | E | E | I | E | R | V | M | H | C | L | D | K | S | T | E | E | P | I | V | K | V | V | E | R | E | L | I | S | K | H | M | K | T | I | V | E | M | E | N | S | G | L | V | H | M | L | K | N | G | K | T | E | D | L | G | C | M | Y | K | L | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . |
Sequence | R | V | P | N | G | L | K | T | M | C | E | C | M | S | S | Y | L | R | E | Q | G | K | A | L | Q | G | L | D | D | L | K | S | R | F | D | R | F | L | L | E | S | F | N | N | D | R | L | F | K | Q | T | I | A | G | D | F | E | Y | F | L | N | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |
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