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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4apcA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: serine/threonine-protein kinase nek1; | PDBTitle: crystal structure of human nima-related kinase 1 (nek1) |
Added to library: Sat Apr 28 14:29:12 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | D | L | G | T | E | N | L | Y | F | Q | S | M | E | K | Y | V | R | L | Q | K | I | K | A | I | L | V | K | S | T | E | D | G | R | Q | Y | V | I | K | E | I | N | I | S | R | M | S | S | K | E | R | E | E | S | R | R | E | V | A | V | L | A | N | M | K | H | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | I | V | Q | Y | R | E | S | F | E | E | N | G | S | L | Y | I | V | M | D | Y | C | E | G | G | D | L | F | K | R | I | N | A | Q | K | G | V | L | F | Q | E | D | Q | I | L | D | W | F | V | Q | I | C | L | A | L | K | H | V | H | D | R | K | I | L | H | R | D | I | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | N | I | F | L | T | K | D | G | T | V | Q | L | G | D | F | G | I | A | R | V | L | N | S | T | V | E | L | A | R | A | C | I | G | T | P | Y | Y | L | S | P | E | I | C | E | N | K | P | Y | N | N | K | S | D | I | W | A | L | G | C | V | L | Y | E | L | C | T | L | K | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | F | E | A | G | S | M | K | N | L | V | L | K | I | I | S | G | S | F | P | P | V | S | L | H | Y | S | Y | D | L | R | S | L | V | S | Q | L | F | K | R | N | P | R | D | R | P | S | V | N | S | I | L | E | K | G | F | I | A | K | R | I | E | K | F | L | S | P | Q | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | T | S | S | G | G | G | S | T | S | T | T | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | E | E | F | C | L | K | T | F | S | K | F | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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