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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ak9A_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: cpftsy; | PDBTitle: structure of chloroplast ftsy from physcomitrella patens |
Added to library: Tue Jan 22 09:07:02 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | Q | D | P | D | I | Q | L | L | F | S | G | F | S | K | T | R | E | N | L | A | V | V | D | E | L | L | T | Y | W | N | L | D | E | S | E | S | I | L | D | E | L | E | E | V | L | L | V | S | D | F | G | P | K | T | A | L | K | I | V | D | T | I | R | K | D | I | L | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | K | S | G | P | Q | I | K | E | A | L | K | K | N | I | F | K | L | L | T | E | R | V | T | T | T | E | L | Q | L | G | N | S | R | P | A | V | L | M | I | V | G | V | N | G | G | G | K | T | T | T | L | G | K | L | A | N | R | F | K | K | E | G | V | K | V | L | M | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | D | T | A | A | A | G | E | Q | L | E | V | W | A | Q | R | T | G | S | E | I | V | M | A | P | R | P | A | A | V | L | S | Q | A | V | R | R | A | V | E | E | D | F | D | V | V | L | C | D | T | S | G | R | L | H | T | N | Y | N | L | M | E | E | L | R | G | C | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | V | S | K | A | L | S | S | A | P | N | E | V | L | L | V | L | D | G | T | T | G | L | N | M | L | A | Q | A | R | E | F | N | Q | V | I | G | V | T | G | F | I | L | T | K | L | D | G | T | A | R | G | G | C | V | V | S | V | V | D | E | L | S | I | P | V | K | F | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | G | E | G | I | D | D | L | Q | P | F | D | A | Q | S | F | V | D | A | L | F | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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