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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ag4A_ | PDB header: immune system/transferase | Chain: A: PDB Molecule: epithelial discoidin domain-containing receptor 1; | PDBTitle: crystal structure of a ddr1-fab complex |
Added to library: Sat Apr 21 12:31:54 2012 | |
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Sequence | K | C | R | Y | A | L | G | M | Q | D | R | T | I | P | D | S | D | I | S | A | S | S | S | W | S | D | S | T | A | A | R | H | S | R | L | E | S | S | D | G | D | G | A | W | C | P | A | G | S | V | F | P | K | E | E | E | Y | L | Q | V | D | L | Q | R | L | H | L | V | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | G | G | G | G | G | G | B | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | T | Q | G | R | H | A | G | G | L | G | K | E | F | S | R | S | Y | R | L | R | Y | S | R | D | G | R | R | W | M | G | W | K | D | R | W | G | Q | E | V | I | S | G | N | E | D | P | E | G | V | V | L | K | D | L | G | P | P | M | V | A | R | L | V | R | F | Y | P | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | B | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | D | R | V | M | S | V | C | L | R | V | E | L | Y | G | C | L | W | R | D | G | L | L | S | Y | T | A | P | V | G | Q | T | M | Y | L | S | E | A | V | Y | L | N | D | S | T | Y | D | G | H | T | V | G | G | L | Q | Y | G | G | L | G | Q | L | A | D | G | V | V | G | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | F | R | K | S | Q | E | L | R | V | W | P | G | Y | D | Y | V | G | W | S | N | H | S | F | S | S | G | Y | V | E | M | E | F | E | F | D | R | L | R | A | F | Q | A | M | Q | V | H | C | N | N | M | H | T | L | G | A | R | L | P | G | G | V | E | C | R | F | R | R | G | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 |
Sequence | A | M | A | W | E | G | E | P | M | R | H | N | L | G | G | N | L | G | D | P | R | A | R | A | V | S | V | P | L | G | G | R | V | A | R | F | L | Q | C | R | F | L | F | A | G | P | W | L | L | F | S | E | I | S | F | I | S | D | A | A | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
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