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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4afiB_ | PDB header: endocytosis | Chain: B: PDB Molecule: ap-3 complex subunit delta-1, vesicle-associated membrane | PDBTitle: complex between vamp7 longin domain and fragment of delta-2 adaptin from ap3 |
Added to library: Sat Jun 2 12:07:19 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | V | E | H | I | P | V | V | Q | I | D | L | S | V | P | L | K | V | P | G | L | P | M | S | D | Q | Y | V | K | L | E | E | A | M | A | I | L | F | A | V | V | A | R | G | T | T | I | L | A | K | H | A | W | C | G | G | N | F | L | E | V | T | E | Q | I | L | A | K | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | E | N | N | K | L | T | Y | S | H | G | N | Y | L | F | H | Y | I | C | Q | D | R | I | V | Y | L | C | I | T | D | D | D | F | E | R | S | R | A | F | S | F | L | N | E | V | K | K | R | F | Q | T | T | Y | G | S | R | A | Q | T | A | L | P | Y | A | M | N | S | E | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | V | L | A | A | Q | L | K | H | H | S | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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