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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zymA_ | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, | PDBTitle: structure of calm (picalm) in complex with vamp8 |
Added to library: Thu Jan 10 01:11:25 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | T | D | R | I | T | A | A | Q | H | S | V | T | G | S | A | V | S | K | T | V | C | K | A | T | T | H | E | I | M | G | P | K | K | K | H | L | D | Y | L | I | Q | C | T | N | E | M | N | V | N | I | P | Q | L | A | D | S | L | F | E | R | T | T | N | S | S | W | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | F | K | S | L | I | T | T | H | H | L | M | V | Y | G | N | E | R | F | I | Q | Y | L | A | S | R | N | T | L | F | N | L | S | N | F | L | D | K | S | G | L | Q | G | Y | D | M | S | T | F | I | R | R | Y | S | R | Y | L | N | E | K | A | V | S | Y | R | Q | V | A | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | T | K | V | K | R | G | A | D | G | V | M | R | T | M | N | T | E | K | L | L | K | T | V | P | I | I | Q | N | Q | M | D | A | L | L | D | F | N | V | N | S | N | E | L | T | N | G | V | I | N | A | A | F | M | L | L | F | K | D | A | I | R | L | F | A | A | Y | N | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | I | N | L | L | E | K | Y | F | D | M | K | K | N | Q | C | K | E | G | L | D | I | Y | K | K | F | L | T | R | M | T | R | I | S | E | F | L | K | V | A | E | Q | V | G | N | L | Q | S | E | V | E | G | V | K | N | I | M | T | Q | N | V | E | R | I | L | A | R | G | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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