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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zwlB_ | PDB header: translation | Chain: B: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 3 subunit i; | PDBTitle: structure of eukaryotic translation initiation factor eif3i complex2 with eif3b c-terminus (655-700) |
Added to library: Wed Jan 9 18:21:38 2013 | |
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Sequence | G | E | N | L | Y | F | Q | G | S | H | M | K | A | I | K | L | T | G | H | E | R | P | L | T | Q | V | K | Y | N | K | E | G | D | L | L | F | S | C | S | K | D | S | S | A | S | V | W | Y | S | L | N | G | E | R | L | G | T | L | D | G | H | T | G | T | I | W | S | I | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | C | F | T | K | Y | C | V | T | G | S | A | D | Y | S | I | K | L | W | D | V | S | N | G | Q | C | V | A | T | W | K | S | P | V | P | V | K | R | V | E | F | S | P | C | G | N | Y | F | L | A | I | L | D | N | V | M | K | N | P | G | S | I | N | I | Y | E | I | E | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | A | T | H | E | L | T | K | V | S | E | E | P | I | H | K | I | I | T | H | E | G | L | D | A | A | T | V | A | G | W | S | T | K | G | K | Y | I | I | A | G | H | K | D | G | K | I | S | K | Y | D | V | S | N | N | Y | E | Y | V | D | S | I | D | L | H | E | K | S | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | M | Q | F | S | P | D | L | T | Y | F | I | T | S | S | R | D | T | N | S | F | L | V | D | V | S | T | L | Q | V | L | K | K | Y | E | T | D | C | P | L | N | T | A | V | I | T | P | L | K | E | F | I | I | L | G | G | G | Q | E | F | E | A | R | F | Y | H | K | I | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | E | I | G | R | V | Q | G | H | F | G | P | L | N | T | V | A | I | S | P | Q | G | T | S | Y | A | S | G | G | E | D | G | F | I | R | L | H | H | F | E | K | S | Y | F | D | F | K | Y | D | V | E | K | A | A | E | A | K | E | H | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T |
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