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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zv0A_ | PDB header: cell cycle | Chain: A: PDB Molecule: protein shq1; | PDBTitle: structure of the shq1p-cbf5p complex |
Added to library: Sat Dec 3 18:16:23 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | L | K | T | K | Y | G | F | D | N | L | Y | D | T | V | I | S | V | S | T | S | N | G | N | D | I | N | E | L | D | D | P | E | H | T | D | A | N | D | R | V | I | E | R | L | R | K | E | N | L | K | F | D | P | E | Y | Y | V | S | E | Y | M | T | H | K | Y | G | N | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | G | G | G | B | S | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | L | E | I | N | G | I | K | E | L | L | K | F | T | P | S | I | V | K | Q | Y | L | Q | W | Y | K | D | S | T | N | P | N | L | V | M | P | I | E | F | T | D | E | E | Q | K | Q | M | Q | D | N | L | P | K | K | S | Y | L | V | E | D | I | K | P | L | Y | V | T | I | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | L | F | S | Y | V | F | E | Q | I | E | N | E | G | T | H | T | T | E | S | A | W | T | M | G | K | L | C | P | Q | I | S | F | L | D | Q | Q | L | K | Q | V | N | S | S | L | I | K | I | A | I | I | T | G | I | R | R | A | L | S | Y | P | L | H | R | N | Y | D | L | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | A | W | T | F | V | Y | Y | I | L | R | G | G | K | R | L | V | I | R | A | L | L | D | I | H | E | T | F | R | F | H | D | V | Y | Y | V | Y | D | K | V | L | L | D | D | L | T | A | W | F | I | S | Q | G | S | E | N | V | I | R | S | L | A | L | E | M | R | K | E | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | S | L | S | K | Q | D | I | E | F | E | C | I | A | S | F | N | E | Q | T | G | E | P | E | W | E | T | L | N | I | R | E | M | E | I | L | A | E | S | E | Y | R | E | Q | Q | Q | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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