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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zpyB_ | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: alginate lyase, family pl7; | PDBTitle: crystal structure of the marine pl7 alginate lyase alya12 from zobellia galactanivorans |
Added to library: Sat Jun 29 08:23:39 2013 | |
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Sequence | N | S | P | A | S | V | L | G | I | T | A | N | T | W | K | I | N | S | F | I | G | S | P | G | S | S | A | T | Y | Y | D | D | I | T | D | A | S | G | I | S | Y | N | T | Y | S | D | D | N | Y | F | Y | T | D | G | E | W | V | Y | F | K | C | Y | R | G | L | G | G | S | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | B | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | Q | N | P | R | V | E | L | R | E | M | D | N | G | N | L | A | S | W | T | G | D | S | G | T | H | T | M | E | W | T | V | Q | V | N | Q | L | P | Q | D | T | D | G | D | G | G | V | L | C | F | G | Q | I | H | G | P | S | K | N | S | D | G | V | E | V | D | D | V | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Q | F | I | G | E | E | N | Q | S | S | G | S | V | K | L | K | I | S | G | Y | V | T | E | E | Q | G | G | S | Q | T | F | S | G | Y | S | L | D | T | T | Y | N | C | K | L | V | Y | S | G | G | Y | V | E | L | F | M | N | G | S | S | V | F | R | K | K | M | E | V | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | L | S | E | N | Y | F | K | V | G | N | Y | L | Q | S | V | K | G | A | S | Y | T | G | S | Y | G | L | V | R | I | K | N | L | S | V | T | H | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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