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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zn3A_ | PDB header: cell cycle | Chain: A: PDB Molecule: anaphase-promoting complex subunit 8; | PDBTitle: n-terminal domain of s. pombe cdc23 apc subunit |
Added to library: Sat Feb 23 08:30:59 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | L | R | E | I | R | N | C | L | L | K | C | I | S | E | C | S | E | R | G | L | V | Y | A | V | R | W | A | A | E | M | L | N | G | M | N | P | I | A | N | E | K | L | L | E | V | E | E | K | N | I | Y | L | L | A | K | S | Y | F | D | C | K | E | F | E | R | A | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | Q | N | C | K | S | S | K | S | I | F | L | R | L | Y | S | K | Y | L | A | G | E | K | K | S | E | N | R | E | F | Y | Y | I | S | E | V | L | E | S | L | H | Y | Q | G | N | K | D | P | Y | L | L | Y | L | S | G | V | V | Y | R | K | R | K | Q | D | S | K | A | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | L | K | S | C | V | L | K | A | P | F | F | W | S | A | W | L | E | L | S | L | S | I | D | S | L | E | T | L | T | T | V | V | S | Q | L | P | S | T | H | I | M | T | K | I | F | Y | V | Y | A | S | H | E | L | H | Q | V | N | S | S | A | Y | E | K | L | A | E | A | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | I | F | P | N | S | R | Y | L | K | T | Q | R | A | L | L | T | Y | D | S | R | F | E | N | I | L | T | N | D | P | A | E | N | L | Y | F | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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