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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zlcA_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: er-derived vesicles protein erv41; | PDBTitle: crystal structure of erv41p |
Added to library: Sat Mar 30 08:19:47 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | D | Q | Q | Y | V | V | D | S | Q | V | R | D | T | V | Q | I | N | M | D | I | Y | V | N | T | K | C | D | W | L | Q | I | N | V | R | D | Q | T | M | D | R | K | L | V | L | E | E | L | Q | L | E | E | M | P | F | F | I | P | Y | D | T | K | V | N | D | I | N | E | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | P | A | E | F | R | E | K | L | D | T | R | S | F | A | H | L | P | E | F | N | G | C | H | V | F | G | S | I | P | V | N | R | V | S | G | E | L | Q | I | T | A | K | S | R | K | A | P | L | E | E | L | K | F | N | H | V | I | N | E | F | S | F | G | D | F | Y | P | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | D | N | P | L | D | N | T | A | Q | F | N | Q | D | E | P | L | T | T | Y | V | Y | Y | T | S | V | V | P | T | L | F | K | K | L | G | A | E | V | D | T | N | Q | Y | S | V | N | D | Y | R | Y | L | Y | K | D | V | A | D | K | M | P | G | I | F | F | K | Y | N | F | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | I | V | V | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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