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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zfsC_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: C: PDB Molecule: f420-reducing hydrogenase, subunit beta; | PDBTitle: cryo-em structure of the f420-reducing nife-hydrogenase2 from a methanogenic archaeon with bound substrate |
Added to library: Sat Mar 9 08:29:17 2013 | |
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Sequence | L | G | T | Y | K | E | I | V | S | A | R | S | T | D | R | E | I | Q | K | L | A | Q | D | G | G | I | V | T | G | L | L | A | Y | A | L | D | E | G | I | I | E | G | A | V | V | A | G | P | G | E | E | F | W | K | P | Q | P | M | V | A | M | S | S | D | E | L | K | A | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | T | K | Y | T | F | S | P | N | V | M | M | L | K | K | A | V | R | Q | Y | G | I | E | K | L | G | T | V | A | I | P | C | Q | T | M | G | I | R | K | M | Q | T | Y | P | F | G | V | R | F | L | A | D | K | I | K | L | L | V | G | I | Y | C | M | E | N | F | P | Y | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | T | T | B | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | Q | T | F | I | C | E | K | L | G | V | S | M | E | L | V | E | K | M | D | I | G | K | G | K | F | W | V | Y | T | Q | D | D | V | L | T | L | P | L | K | E | T | H | G | Y | E | Q | A | G | C | K | I | C | K | D | Y | V | A | E | L | A | D | V | S | T | G | S | V | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | D | G | W | S | T | V | I | T | R | T | D | A | G | D | S | I | F | K | Q | A | V | E | A | G | L | F | E | T | K | P | I | E | E | V | K | P | G | L | G | L | L | E | K | L | A | A | Q | K | K | E | K | A | E | K | N | I | A | A | R | K | E | M | G | L | P | T | P | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S |
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