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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zeyP_ | PDB header: ribosome | Chain: P: PDB Molecule: 40s ribosomal protein s2, putative; | PDBTitle: high-resolution cryo-electron microscopy structure of the trypanosoma2 brucei ribosome |
Added to library: Sat Feb 16 08:39:32 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | K | E | W | V | P | C | T | K | L | G | R | L | V | K | D | Q | K | I | T | S | L | E | E | I | F | L | F | S | M | P | I | K | E | H | Q | I | V | D | Q | L | I | R | E | G | D | L | R | D | E | M | M | L | V | F | P | V | Q | K | A | T | S | A | G | Q | R | T | R | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | F | N | V | V | G | D | G | N | G | H | I | G | V | G | A | R | V | G | K | E | V | S | L | A | I | R | A | S | M | I | A | A | K | L | S | I | V | P | V | R | R | G | Y | W | G | N | K | I | G | E | P | H | T | I | P | I | K | V | T | G | K | C | G | S | V | A | V | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | B | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | P | A | P | R | G | A | G | I | V | A | A | P | V | P | K | K | I | L | E | F | A | G | V | E | D | V | Y | T | S | S | C | G | K | T | R | T | R | G | N | F | I | M | A | T | F | Y | A | L | R | K | T | Y | G | F | L | T | P | D | L | W | A | E | T | E | V | S | R | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | D | E | H | S | E | F | L | S | M | G | R | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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