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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zey7_ | PDB header: ribosome | Chain: 7: PDB Molecule: guanine nucleotide-binding protein beta subunit-like | PDBTitle: high-resolution cryo-electron microscopy structure of the trypanosoma2 brucei ribosome |
Added to library: Sat Feb 16 09:20:35 2013 | |
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Sequence | M | A | V | A | Y | E | G | Q | L | T | G | H | R | G | W | V | T | S | L | A | C | P | Q | T | P | E | T | A | T | K | V | V | S | T | S | R | D | K | T | L | L | S | W | G | P | N | P | D | R | H | S | S | E | C | S | Y | G | L | P | D | R | R | L | E | G | H | S | A | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | D | V | A | L | S | N | N | G | N | F | A | V | S | A | S | W | D | H | S | L | R | L | W | N | L | Q | N | G | Q | C | Q | Y | K | F | L | G | H | T | K | D | V | L | S | V | A | F | S | P | D | N | R | Q | I | V | S | G | G | R | D | N | A | L | R | V | W | N | V | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | C | M | H | T | L | S | R | G | A | H | T | D | W | V | S | C | V | R | F | S | P | S | L | D | A | P | V | I | V | S | G | G | W | D | N | L | V | K | V | W | D | L | A | T | G | R | L | V | T | D | L | K | G | H | T | N | Y | V | T | S | V | T | V | S | P | D | G | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | A | S | S | D | K | D | G | V | A | R | L | W | D | L | T | K | G | E | A | L | S | E | M | A | A | G | A | P | I | N | Q | I | C | F | S | P | N | R | Y | W | M | C | A | A | T | E | K | G | I | R | I | F | D | L | E | N | K | D | I | I | V | E | L | A | P | E | H | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | S | K | K | I | V | P | E | C | V | S | I | A | W | S | A | D | G | S | T | L | Y | S | G | Y | T | D | N | V | I | R | V | W | G | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S |
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