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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zduA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: cyclin-dependent kinase-like 3; | PDBTitle: crystal structure of the human cdkl3 kinase domain |
Added to library: Sat Mar 23 10:15:09 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | M | Y | E | T | L | G | K | V | G | E | G | S | Y | G | T | V | M | K | C | K | H | K | N | T | G | Q | I | V | A | I | K | I | F | Y | N | K | I | A | M | R | E | I | K | F | L | K | Q | F | H | H | E | N | L | V | N | L | I | E | V | F | R | Q | K | K | K | I | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | F | E | F | I | D | H | T | V | L | D | E | L | Q | H | Y | C | H | G | L | E | S | K | R | L | R | K | Y | L | F | Q | I | L | R | A | I | D | Y | L | H | S | N | N | I | I | H | R | D | I | K | P | E | N | I | L | V | S | Q | S | G | I | T | K | L | C | D | F | G | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | B | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | T | D | I | Y | D | D | E | V | A | T | R | W | Y | R | A | P | E | L | V | L | K | D | T | S | Y | G | K | P | V | D | I | W | A | L | G | C | M | I | I | E | M | A | T | G | N | P | Y | L | P | S | S | S | D | L | D | L | L | H | K | I | V | L | K | V | G | N | L | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | L | Q | N | I | F | S | K | S | P | I | F | A | G | V | V | L | P | Q | V | Q | H | P | K | N | A | R | K | K | Y | P | K | L | N | G | L | L | A | D | I | V | H | A | C | L | Q | I | D | P | A | D | R | I | S | S | S | D | L | L | H | H | E | Y | F | T | R | D | G | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | K | F | M | P | E | L | K | A | K | L | L | Q | E | A | K | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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