|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3zcjD_ | PDB header: protein binding | Chain: D: PDB Molecule: cagl; | PDBTitle: crystal structure of helicobacter pylori t4ss protein cagl in a2 tetragonal crystal form with a helical rgd-motif (6 mol per asu) |
Added to library: Sat Oct 12 08:28:22 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | I | T | S | G | L | Q | L | D | S | T | Y | Q | E | T | N | Q | Q | V | L | N | L | D | E | I | M | G | E | E | D | A | L | N | I | A | A | I | A | L | R | G | D | L | A | L | L | A | N | F | E | A | N | E | L | F | F | I | S | E | D | V | I | F | T | Y | M | S | S | P | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | T | Y | M | I | N | P | L | D | Q | N | T | A | E | Q | Q | C | G | I | S | D | V | L | V | L | Y | C | E | G | L | I | E | Q | E | Q | N | I | R | E | R | L | E | T | S | L | A | Y | Q | S | N | I | G | G | T | A | S | L | I | T | A | S | Q | T | L | V | E | S | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | N | F | I | G | I | R | L | M | L | A | H | N | V | F | L | N | Y | L | E | E | L | D | A | L | E | R | S | L | E | Q | S | R | Q | Y | L | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|