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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wz1A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: agarase; | PDBTitle: catalytic domain of beta-agarase from microbulbifer thermotolerans2 jamb-a94 |
Added to library: Sat Nov 22 08:19:16 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | D | W | D | G | V | P | V | P | A | N | P | G | S | G | K | T | W | E | L | H | P | L | S | D | D | F | N | Y | E | A | P | A | A | G | K | S | T | R | F | Y | E | R | W | K | E | G | F | I | N | P | W | T | G | P | G | L | T | E | W | H | P | H | Y | S | Y | V | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | B | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | K | L | A | I | T | S | G | R | K | P | G | T | N | Q | V | Y | L | G | S | I | T | S | K | A | P | L | T | Y | P | V | Y | M | E | A | R | A | K | L | S | N | M | V | L | A | S | D | F | W | F | L | S | A | D | S | T | E | E | I | D | V | I | E | A | Y | G | S | D | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | Q | E | W | Y | A | E | R | L | H | L | S | H | H | V | F | I | R | D | P | F | Q | D | Y | Q | P | T | D | A | G | S | W | Y | A | D | G | K | G | T | K | W | R | D | A | F | H | R | V | G | V | Y | W | R | D | P | W | H | L | E | Y | Y | V | D | G | K | L | V | R | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | G | Q | D | I | I | D | P | N | G | F | T | G | G | T | G | L | S | K | P | M | Y | A | I | I | N | M | E | D | Q | N | W | R | S | D | N | G | I | T | P | T | D | A | E | L | A | D | P | N | R | N | T | Y | Y | V | D | W | V | R | F | Y | K | P | V | P | I | N | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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