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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wrnA_ | PDB header: replication | Chain: A: PDB Molecule: non-capsid protein ns-1; | PDBTitle: minute virus of mice non-structural protein-1n-terminal nuclease2 domain reveals a unique zn2+ coordination in the active site pocket3 and shows a novel mode of dna recognition at the origin of4 replication |
Added to library: Sat Jan 24 08:15:07 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | S | D | E | V | L | G | A | T | N | W | L | K | E | K | S | N | Q | E | V | F | S | F | V | F | K | N | E | N | V | Q | L | N | G | K | D | I | G | W | N | S | Y | K | K | E | L | Q | E | D | E | L | K | S | L | Q | R | G | A | E | T | T | W | D | Q | S | E | D | M | E | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | T | V | D | E | M | T | K | K | Q | V | F | I | F | D | S | L | V | K | K | C | L | F | E | V | L | N | T | K | N | I | F | P | G | D | V | N | W | F | V | Q | H | E | W | G | K | D | Q | G | W | H | C | H | V | L | I | G | G | K | D | F | S | Q | A | Q | G | K | W | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | Q | L | N | V | Y | W | S | R | W | L | V | T | A | C | N | V | Q | L | T | P | A | E | R | I | K | L | R | E | I | A | E | D | N | E | W | V | T | L | L | T | Y | K | H | K | Q | T | K | K | D | Y | T | K | C | V | L | F | G | N | M | I | A | Y | Y | F | L | T | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | B | S | S | S | B | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | K | I | S | T | S | P | P | R | D | G | G | Y | F | L | S | S | D | S | G | W | K | T | N | F | L | K | E | G | E | R | H | L | V | S | K | L | Y | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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