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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wqaA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: trimeric autotransporter adhesin; | PDBTitle: acinetobacter sp. tol 5 ataa ydd-dall3 domains in c-terminal stalk2 fused to gcn4 adaptors (cstalkc1ii) |
Added to library: Sat Mar 7 08:18:53 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | D | K | I | E | E | I | L | S | K | I | Y | H | I | E | N | E | I | A | R | I | K | K | L | I | D | S | A | I | N | N | V | N | N | N | V | N | E | L | A | N | N | A | V | K | Y | D | D | A | S | K | D | K | I | T | L | G | G | G | A | T | G | T | T | I | T | N | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | T | V | A | Q | G | S | K | D | A | V | N | G | G | Q | L | W | N | V | Q | Q | Q | V | D | Q | N | T | T | D | I | S | N | I | K | N | D | I | N | N | G | T | V | G | L | V | Q | Q | A | G | K | D | A | P | V | T | V | A | K | D | T | G | G | T | T | V | N | V | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . |
Sequence | T | D | G | N | R | V | V | T | G | V | K | E | G | A | V | N | A | T | S | K | D | A | V | N | G | S | Q | M | K | Q | I | E | D | K | I | E | E | I | L | S | K | I | Y | H | I | E | N | E | I | A | R | I | K | K | L | I | K | L | H | H | H | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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