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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c3wpwB_ | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: pomb; | PDBTitle: structure of pombc5, a periplasmic fragment of pomb from vibrio | 
| Added to library: Sat Sep 13 08:33:40 2014 | |
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| Sequence | S | Q | E | M | E | T | L | M | E | S | I | K | K | A | L | E | R | E | I | E | Q | G | A | I | E | V | E | N | L | G | Q | Q | I | V | I | R | M | R | E | K | G | A | F | P | E | G | S | A | F | L | Q | P | K | F | R | P | L | V | R | Q | I | A | E | L | V | K | D | V | P | G | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  | T | S |  |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | I | V | R | V | S | G | H | T | D | N | R | P | L | D | S | E | L | Y | R | S | N | W | D | L | S | S | Q | R | A | V | S | V | A | Q | E | M | E | K | V | R | G | F | S | H | Q | R | L | R | V | R | G | M | A | D | T | E | P | L | L | P | N | D | S | D | D | N | R | A | L | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  | S | S | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | T | T | G | G | G |  |  |  |  |  | T | T | S | S | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||
| Sequence | R | R | V | E | I | S | I | M | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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