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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wo9A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: variable lymphocyte receptor c; | PDBTitle: crystal structure of the lamprey variable lymphocyte receptor c |
Added to library: Sat Mar 8 08:30:15 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | M | A | C | L | A | V | G | K | D | D | I | C | T | C | S | N | K | T | D | S | S | P | E | T | V | D | C | S | S | K | K | L | T | A | V | P | T | G | I | P | A | N | T | E | K | L | Q | L | D | F | N | Q | L | A | N | I | P | A | E | A | F | H | G | L | T | R | L | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | B | T | T | B | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | L | D | Y | N | Q | L | Q | S | L | P | V | G | V | F | D | Q | L | N | N | L | N | E | L | R | L | Q | D | N | Q | L | T | S | L | P | P | G | V | F | D | S | L | T | K | L | T | Y | L | T | L | S | Q | N | Q | L | Q | S | I | P | A | G | V | F | D | K | L | T | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | R | L | E | L | S | T | N | Q | L | Q | S | V | P | H | G | A | F | D | S | L | V | N | L | E | T | L | H | L | E | L | N | P | W | D | C | A | C | S | D | I | I | Y | L | R | T | F | I | A | K | N | T | D | K | I | S | G | M | E | S | A | Q | C | N | G | T | S | T | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | B | B | T | T | T | S | S | B | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | K | D | V | N | T | E | K | I | K | N | V | T | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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