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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wi3B_ | PDB header: replication regulator | Chain: B: PDB Molecule: dna replication regulator sld3; | PDBTitle: crystal structure of the sld3/treslin domain from yeast sld3 |
Added to library: Sat Aug 23 08:15:03 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | S | D | P | K | E | Y | I | E | S | K | Y | Y | D | A | L | F | S | I | H | T | P | L | A | Y | F | V | K | S | N | L | V | R | L | K | N | T | C | R | T | K | Y | G | S | D | S | Y | K | I | A | Y | Q | A | M | L | Q | K | F | L | L | S | I | V | Q | F | K | D | R | H | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | R | L | L | L | E | P | F | S | S | P | I | A | D | E | K | R | K | N | C | L | T | K | F | V | I | Q | D | E | N | K | N | S | S | T | I | A | D | L | C | V | V | L | K | S | R | E | I | K | L | Q | I | L | L | L | L | E | I | I | G | L | N | D | L | D | W | N | F | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | C | E | Q | L | D | L | Y | L | D | R | A | C | I | L | D | I | L | L | S | S | E | S | N | G | T | I | Q | E | H | K | K | N | I | L | D | K | S | K | E | A | S | L | V | G | F | I | N | Y | V | L | I | P | Y | F | N | K | K | V | P | H | A | V | E | F | I | I | Q | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | S | S | S | S |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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