|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3vu4B_ | PDB header: protein transport | Chain: B: PDB Molecule: kmhsv2; | PDBTitle: crystal structure of kluyvelomyces marxianus hsv2 |
Added to library: Wed Jan 9 15:42:00 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | N | P | V | T | D | Y | E | F | N | Q | D | Q | S | C | L | I | L | S | T | L | K | S | F | E | I | Y | N | V | H | P | V | A | H | I | M | S | Q | E | M | R | H | L | S | K | V | R | M | L | H | R | T | N | Y | V | A | F | V | T | G | V | K | E | V | V | H | I | W | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | K | K | Q | D | V | S | R | I | K | V | D | A | P | V | K | D | L | F | L | S | R | E | F | I | V | V | S | Y | G | D | V | I | S | V | F | K | F | G | N | P | W | K | R | I | T | D | D | I | R | F | G | G | V | C | E | F | S | N | G | L | L | V | Y | S | N | E | F | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | Q | I | H | I | T | K | L | Q | K | G | V | L | I | K | A | H | T | N | P | I | K | M | V | R | L | N | R | K | S | D | M | V | A | T | C | S | Q | D | G | T | I | I | R | V | F | K | T | E | D | G | V | L | V | R | E | F | R | R | G | L | D | R | A | D | V | V | D | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | W | S | T | D | G | S | K | L | A | V | V | S | D | K | W | T | L | H | V | F | E | I | F | N | D | Q | S | E | W | S | L | C | N | F | K | L | S | V | D | K | H | V | R | G | C | K | I | A | W | I | S | E | S | S | L | V | V | V | W | P | H | T | R | M | I | E | T | F | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | F | D | D | E | M | E | R | W | L | I | Q | M | D | Q | R | E | Q | L | M | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|