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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c3v5qB_ | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: B: PDB Molecule: nt-3 growth factor receptor; | PDBTitle: discovery of a selective trk inhibitor with efficacy in rodent cancer2 tumor models | 
| Added to library: Sat Feb 11 14:14:10 2012 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | G | I | H | V | Q | H | I | K | R | R | D | I | V | L | K | R | E | L | G | F | K | V | F | L | A | E | C | Y | N | L | S | P | T | K | D | K | M | L | V | A | V | K | A | L | K | D | P | T | L | A | A | R | K | D | F | Q | R | E | A | E | L | L | T | N | L | Q | H | E | H | I | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | V | K | F | Y | G | V | C | G | D | P | L | I | M | V | F | E | Y | M | K | H | G | D | L | N | K | F | L | R | A | H | G | P | E | L | G | L | S | Q | M | L | H | I | A | S | Q | I | A | S | G | M | V | Y | L | A | S | Q | H | F | V | H | R | D | L | A | T | R | N | C | L | V | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | S | G | G | G |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | G | A | N | L | L | V | K | I | G | D | F | G | M | D | V | Y | S | T | D | Y | Y | R | T | M | L | P | I | R | W | M | P | P | E | S | I | M | Y | R | K | F | T | T | E | S | D | V | W | S | F | G | V | I | L | W | E | I | F | T | Y | G | K | Q | P | W | F | Q | L | S | N | T | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |  |  |  | S | G | G | G | B | B | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | S | T | T | T | T | S |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | 
| Sequence | E | V | I | E | C | I | T | Q | G | R | V | L | E | R | P | R | V | C | P | K | E | V | Y | D | V | M | L | G | C | W | Q | R | E | P | Q | Q | R | L | N | I | K | E | I | Y | K | I | L | H | A | L | G | K | A | T | P | |||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S | G | G | G | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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