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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3v3kB_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: putative uncharacterized protein ecs1815; | PDBTitle: human caspase 9 in complex with bacterial effector protein |
Added to library: Sat Mar 9 08:28:55 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | P | E | S | V | S | E | L | N | H | N | H | F | L | S | P | E | L | Q | D | K | L | D | V | M | V | S | I | Y | S | C | A | R | N | N | N | E | L | E | E | I | F | Q | E | L | S | A | F | V | S | G | L | M | D | K | R | N | S | V | F | E | V | R | N | E | N | T | D | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | A | L | R | A | G | M | T | I | E | D | R | D | S | Y | I | R | D | L | F | F | L | H | S | L | K | V | K | I | E | E | S | R | Q | G | K | E | D | S | K | C | K | V | Y | N | L | L | C | P | H | H | S | S | E | L | Y | G | D | L | R | A | M | K | C | L | V | E | G | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | D | D | F | N | P | F | D | I | I | R | V | P | D | L | T | Y | N | K | G | S | L | Q | C | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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