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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3v00C_ | PDB header: signaling protein | Chain: C: PDB Molecule: guanine nucleotide-binding protein g(t) subunit alpha-1/ | PDBTitle: studies of a constitutively active g-alpha subunit provide insights2 into the mechanism of g protein activation. |
Added to library: Wed Jan 9 14:49:31 2013 | |
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Sequence | H | H | H | M | G | A | G | A | S | A | E | E | K | H | S | R | E | L | E | K | K | L | K | E | D | A | E | K | D | A | R | T | V | K | L | L | L | L | G | A | G | E | S | G | K | S | T | I | V | K | Q | M | K | I | I | H | Q | D | P | Y | S | L | E | E | C | L | E | F | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | Y | G | N | T | L | Q | S | I | L | A | I | V | R | A | M | T | T | L | N | I | Q | Y | G | D | S | A | R | Q | D | D | A | R | K | L | M | H | M | A | D | T | I | E | E | G | T | M | P | K | E | M | S | D | I | I | Q | R | L | W | K | D | S | G | I | Q | A | C | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | A | S | E | Y | Q | L | N | D | S | A | G | Y | Y | L | S | D | L | E | R | L | V | T | P | G | Y | V | P | T | E | Q | D | V | L | R | S | R | V | K | T | T | G | I | I | E | T | Q | F | S | F | K | D | L | N | F | R | M | F | D | V | G | G | Q | R | S | E | R | K | K | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | H | C | F | E | G | V | T | A | I | I | F | C | V | A | L | S | D | Y | D | L | V | L | A | E | D | E | E | M | N | R | M | H | E | S | M | H | L | F | N | S | I | C | N | N | K | W | F | T | D | T | S | I | I | L | F | L | N | K | K | D | L | F | E | E | K | I | K | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | P | L | T | I | C | Y | P | E | Y | A | G | S | N | T | Y | E | E | A | G | N | Y | I | K | V | Q | F | L | E | L | N | M | R | R | D | V | K | E | I | Y | S | H | M | T | C | A | T | D | T | Q | N | V | K | F | V | F | D | A | V | T | D | I | I | I | K | E | N | L | K | D | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | L | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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