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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ux4C_ | PDB header: transport protein | Chain: C: PDB Molecule: acid-activated urea channel; | PDBTitle: crystal structure of the urea channel from the human gastric pathogen2 helicobacter pylori |
Added to library: Thu Jan 10 04:12:13 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | L | G | L | V | L | L | Y | V | G | I | V | L | I | S | N | G | I | C | G | L | T | K | V | D | P | K | S | T | A | V | M | N | F | F | V | G | G | L | S | I | V | C | N | V | V | V | I | T | Y | S | A | L | H | P | T | A | P | S | F | Y | G | P | A | T | G | L | L | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | T | Y | L | Y | A | A | I | N | H | T | F | G | L | D | W | R | P | Y | S | W | Y | S | L | F | V | A | I | N | T | V | P | A | A | I | L | S | H | Y | S | D | M | L | D | D | H | K | V | L | G | I | T | E | G | D | W | W | A | I | I | W | L | A | W | G | V | L | W | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||
Sequence | A | F | I | E | N | I | L | K | I | P | L | G | K | F | T | P | W | L | A | I | I | E | G | I | L | T | A | W | I | P | A | W | L | L | F | I | Q | H | W | V | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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