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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3un9A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: nlr family member x1; | PDBTitle: crystal structure of an immune receptor |
Added to library: Sat Mar 31 12:01:07 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | Q | V | L | P | P | S | E | L | L | D | H | L | F | F | H | Y | E | F | Q | N | Q | R | F | S | A | E | V | L | S | S | L | R | Q | L | N | L | A | G | V | R | M | T | P | V | K | C | T | V | V | A | A | V | L | G | S | G | R | H | A | L | D | E | V | N | L | A | S | C | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | P | A | G | L | R | T | L | L | P | V | F | L | R | A | R | K | L | G | L | Q | L | N | S | L | G | P | E | A | C | K | D | L | R | D | L | L | L | H | D | Q | C | Q | I | T | T | L | R | L | S | N | N | P | L | T | A | A | G | V | A | V | L | M | E | G | L | A | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | S | V | T | H | L | S | L | L | H | T | G | L | G | D | E | G | L | E | L | L | A | A | Q | L | D | R | N | R | Q | L | Q | E | L | N | V | A | Y | N | G | A | G | D | T | A | A | L | A | L | A | R | A | A | R | E | H | P | S | L | E | L | L | H | L | Y | F | N | E | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | E | G | R | Q | V | L | R | D | L | G | A | R | V | V | V | S | L | T | V | S | E | Y | W | S | V | I | L | S | E | V | Q | R | N | L | N | S | W | D | R | A | R | V | Q | R | H | L | E | L | L | L | R | D | L | E | D | S | R | G | A | T | L | N | P | W | R | K | A | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | R | V | E | G | E | V | R | A | L | L | E | Q | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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