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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ulqA_ | PDB header: gene regulation/transcription activator | Chain: A: PDB Molecule: response regulator aspartate phosphatase f; | PDBTitle: crystal structure of the anti-activator rapf complexed with the2 response regulator coma dna binding domain |
Added to library: Sun Jan 8 00:01:54 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | S | S | S | I | G | E | K | I | N | E | W | Y | M | Y | I | R | R | F | S | I | P | D | A | E | Y | L | R | R | E | I | K | Q | E | L | D | Q | M | E | E | D | Q | D | L | H | L | Y | Y | S | L | M | E | F | R | H | N | L | M | L | E | Y | L | E | P | L | E | K | M | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | G | G | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | E | Q | P | R | L | S | D | L | L | L | E | I | D | K | K | Q | A | R | L | T | G | L | L | E | Y | Y | F | N | F | F | R | G | M | Y | E | L | D | Q | R | E | Y | L | S | A | I | K | F | F | K | K | A | E | S | K | L | I | F | V | K | D | R | I | E | K | A | E | F | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | M | S | E | S | Y | Y | Y | M | K | Q | T | Y | F | S | M | D | Y | A | R | Q | A | Y | E | I | Y | K | E | H | E | A | Y | N | I | R | L | L | Q | C | H | S | L | F | A | T | N | F | L | D | L | K | Q | Y | E | D | A | I | S | H | F | Q | K | A | Y | S | M | A | E | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | Q | P | Q | L | M | G | R | T | L | Y | N | I | G | L | C | K | N | S | Q | S | Q | Y | E | D | A | I | P | Y | F | K | R | A | I | A | V | F | E | E | S | N | I | L | P | S | L | P | Q | A | Y | F | L | I | T | Q | I | H | Y | K | L | G | K | I | D | K | A | H | E | Y | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | S | K | G | M | A | Y | S | Q | K | A | G | D | V | I | Y | L | S | E | F | E | F | L | K | S | L | Y | L | S | G | P | D | E | E | A | I | Q | G | F | F | D | F | L | E | S | K | M | L | Y | A | D | L | E | D | F | A | I | D | V | A | K | Y | Y | H | E | R | K | N | F | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | S | A | Y | F | L | K | V | E | Q | V | R | Q | L | I | Q | G | G | V | S | L | Y | E | I | E | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S |
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