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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3u64A_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: protein tp_0956; | PDBTitle: the crystal structure of tat-t (tp0956) |
Added to library: Sat Feb 25 11:28:01 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | T | R | V | F | T | E | E | D | D | L | D | L | V | A | Q | S | L | P | L | V | L | K | V | Y | E | A | L | H | L | Q | N | P | A | H | R | G | L | S | L | A | V | G | R | L | Y | I | M | Y | A | N | A | F | V | Q | T | P | A | Q | Y | L | P | E | D | E | F | E | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | E | A | Y | S | R | A | R | K | L | Y | L | R | G | A | R | Y | A | L | S | S | L | E | T | A | Y | P | G | F | T | R | E | V | F | S | G | D | E | Q | R | L | H | K | V | L | S | R | C | T | R | V | D | V | G | T | L | Y | W | V | G | T | G | Y | V | A | A | F | A | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | L | G | S | A | L | P | D | T | V | H | A | A | V | M | M | L | E | R | A | C | D | L | W | P | S | Y | Q | E | G | A | V | W | N | V | L | T | K | F | Y | A | A | A | P | E | S | F | G | G | G | M | E | K | A | H | T | A | F | E | H | L | T | R | Y | C | S | A | H | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . |
Sequence | D | H | H | I | T | Y | A | D | A | L | C | I | P | L | N | N | R | A | G | F | D | E | A | L | D | R | A | L | A | I | D | P | E | S | V | P | H | N | K | L | L | V | I | L | S | Q | K | R | A | R | W | L | K | A | H | V | Q | D | F | F | L | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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