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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3u5pF_ | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase trim33; | PDBTitle: crystal structure of the complex of trim33 phd-bromo and h3(1-28)2 k9me3k14ack18ack23ac histone peptide |
Added to library: Sat Jan 28 17:48:33 2012 | |
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Sequence | D | P | N | E | D | W | C | A | V | C | Q | N | G | G | D | L | L | C | C | E | K | C | P | K | V | F | H | L | T | C | H | V | P | T | L | L | S | F | P | S | G | D | W | I | C | T | F | C | R | D | I | G | K | P | E | V | E | Y | D | C | D | N | L | Q | H | S | K | G | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | V | D | Q | R | K | C | E | R | L | L | L | Y | L | Y | C | H | E | L | S | I | E | F | Q | E | P | V | P | A | S | I | P | N | Y | Y | K | I | I | K | K | P | M | D | L | S | T | V | K | K | K | L | Q | K | K | H | S | Q | H | Y | Q | I | P | D | D | F | V | A | D | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | |
Sequence | L | I | F | K | N | C | E | R | F | N | E | M | M | K | V | V | Q | V | Y | A | S | E | V | A | Q | A | G | K | A | V | A | L | Y | F | E | D | K | L | T | E | I | Y | S | D | R | T | F | A | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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