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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3u4fC_ | PDB header: isomerase | Chain: C: PDB Molecule: mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family | PDBTitle: crystal structure of a mandelate racemase (muconate lactonizing enzyme2 family protein) from roseovarius nubinhibens |
Added to library: Thu Jan 10 01:16:54 2013 | |
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Sequence | F | Q | S | X | K | L | T | A | I | E | T | F | T | N | E | F | V | G | F | V | R | V | T | S | E | D | G | A | R | G | W | G | Q | V | S | T | Y | H | S | D | I | T | C | E | V | L | H | R | Q | V | A | P | W | X | L | G | Q | D | C | S | D | L | D | D | L | L | D | L | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | R | E | H | K | F | P | G | S | Y | L | R | R | A | X | A | G | V | D | T | A | I | W | D | L | R | G | K | Q | A | G | K | P | V | A | E | L | L | G | G | S | A | G | T | I | R | A | Y | A | S | S | X | K | R | D | I | T | P | H | D | E | A | E | R | X | K | R | L | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | S | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | H | G | F | D | A | F | K | V | R | A | G | A | E | V | G | R | G | R | D | E | W | P | G | R | T | E | E | I | V | P | T | X | R | R | E | X | G | D | S | A | A | L | L | I | D | A | N | S | C | Y | A | P | A | Q | A | I | E | L | G | K | L | L | Q | D | H | G | F | S | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | E | E | P | C | P | Y | W | E | L | E | Q | T | K | E | V | S | E | A | L | D | I | D | V | T | G | G | E | Q | D | C | D | L | T | T | W | R | R | X | I | D | X | R | A | V | D | V | V | Q | P | D | I | L | Y | L | G | G | I | C | R | T | L | R | V | A | R | X | A | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | A | A | L | P | V | T | P | H | C | A | N | L | S | L | V | T | L | F | T | X | H | L | L | R | A | I | P | N | A | G | K | Y | L | E | F | S | I | E | G | E | D | Y | Y | P | W | Q | D | G | L | F | V | E | D | P | Y | R | I | E | D | G | H | A | R | V | T | E | A | P | G | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T | T | B | S | T | T | T | G | G | G | T | T | B | S | S | S | B | T | T | S | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | G | V | E | I | C | P | E | W | L | A | R | S | A | Y | K | V | S | R | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | S |
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