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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3u1lA_ | PDB header: splicing | Chain: A: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor cwc2; | PDBTitle: structure of the mrna splicing complex component cwc2 |
Added to library: Sat Nov 19 19:45:45 2011 | |
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Sequence | S | W | R | D | K | S | A | K | V | Q | V | K | E | S | E | L | P | S | S | I | P | A | Q | T | G | L | T | F | N | I | W | Y | N | K | W | S | Q | G | F | A | G | N | T | R | F | V | S | P | F | A | L | Q | P | Q | L | H | S | G | K | T | R | G | D | N | D | G | Q | L | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | B | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | L | F | F | A | K | G | M | C | C | L | G | P | K | C | E | Y | L | H | H | I | P | D | E | E | D | I | G | K | L | A | L | R | T | E | V | L | D | C | F | G | R | E | K | F | A | D | Y | R | R | K | K | N | K | T | L | Y | V | G | G | I | D | G | A | L | N | S | K | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | S | B | B | S | S | S | B | T | T | S | S | B | G | G | G | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | P | A | Q | I | E | S | R | I | R | F | V | F | S | R | L | G | D | I | D | R | I | R | Y | V | E | S | K | N | C | G | F | V | K | F | K | Y | Q | A | N | A | E | F | A | K | E | A | M | S | N | Q | T | L | L | L | P | S | D | K | E | W | D | D | R | R | E | G | T | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | V | K | W | A | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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