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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3ty3A_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: probable homoisocitrate dehydrogenase; | PDBTitle: crystal structure of homoisocitrate dehydrogenase from2 schizosaccharomyces pombe bound to glycyl-glycyl-glycine |
Added to library: Thu Jan 10 08:21:31 2013 | |
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Sequence | R | R | I | V | L | G | L | I | P | A | D | G | I | G | K | E | V | V | P | A | A | R | R | L | M | E | N | L | P | A | K | H | K | L | K | F | D | F | I | D | L | D | A | G | W | G | T | F | E | R | T | G | K | A | L | P | E | R | T | V | E | R | L | K | T | E | C | N | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | F | G | A | V | Q | S | P | T | H | K | V | A | G | Y | S | S | P | I | V | A | L | R | K | K | M | G | L | Y | A | N | V | R | P | V | K | S | L | D | G | A | K | G | K | P | V | D | L | V | I | V | R | E | N | T | E | C | L | Y | V | K | E | E | R | M | V | Q | N | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | B | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | R | V | A | E | A | I | R | R | I | S | E | E | A | S | T | K | I | G | K | M | A | F | E | I | A | K | S | R | Q | K | I | R | E | S | G | T | Y | S | I | H | K | K | P | L | V | T | I | I | H | K | S | N | V | M | S | V | T | D | G | L | F | R | E | S | C | R | H | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | S | L | D | P | S | Y | A | S | I | N | V | D | E | Q | I | V | D | S | M | V | Y | R | L | F | R | E | P | E | C | F | D | V | V | V | A | P | N | L | Y | G | D | I | L | S | D | G | A | A | S | L | I | G | S | L | G | L | V | P | S | A | N | V | G | D | N | F | V | M | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | E | P | V | H | G | S | A | P | D | I | A | G | R | G | I | A | N | P | V | A | T | F | R | S | V | A | L | M | L | E | F | M | G | H | Q | D | A | A | A | D | I | Y | T | A | V | D | K | V | L | T | E | G | K | V | L | T | P | D | L | G | G | K | S | G | T | N | E | I | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | L | A | N | I | H | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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