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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3txmA_ | PDB header: hydrolase, protein binding | Chain: A: PDB Molecule: 26s proteasome regulatory complex subunit p42b; | PDBTitle: crystal structure of rpn6 from drosophila melanogaster, gd(3+) complex |
Added to library: Sat Dec 17 18:00:14 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | D | E | E | R | I | R | I | K | E | Q | G | I | L | Q | Q | G | E | L | Y | K | Q | E | G | K | A | K | E | L | A | D | L | I | K | V | T | R | P | F | L | S | S | I | S | K | A | K | A | A | K | L | V | R | S | L | V | D | M | F | L | D | M | D | A | G | T | G | I | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | C | K | D | C | I | E | W | A | K | Q | E | K | R | T | F | L | R | Q | S | L | E | A | R | L | I | A | L | Y | F | D | T | A | L | Y | T | E | A | L | A | L | G | A | Q | L | L | R | E | L | K | K | L | D | D | K | N | L | L | V | E | V | Q | L | L | E | S | K | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | A | L | S | N | L | P | K | A | R | A | A | L | T | S | A | R | T | T | A | N | A | I | Y | C | P | P | K | V | Q | G | A | L | D | L | Q | S | G | I | L | H | A | A | D | E | R | D | F | K | T | A | F | S | Y | F | Y | E | A | F | E | G | F | D | S | V | D | S | V | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | T | S | L | K | Y | M | L | L | C | K | I | M | L | G | Q | S | D | D | V | N | Q | L | V | S | G | K | L | A | I | T | Y | S | G | R | D | I | D | A | M | K | S | V | A | E | A | S | H | K | R | S | L | A | D | F | Q | A | A | L | K | E | Y | K | K | E | L | A | E | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | V | Q | A | H | L | G | T | L | Y | D | T | M | L | E | Q | N | L | C | R | I | I | E | P | Y | S | R | V | Q | V | A | H | V | A | E | S | I | Q | L | P | M | P | Q | V | E | K | K | L | S | Q | M | I | L | D | K | K | F | S | G | I | L | D | Q | G | E | G | V | L | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | E | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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