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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3tt9A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: plakophilin-2; | PDBTitle: crystal structure of the stable degradation fragment of human2 plakophilin 2 isoform a (pkp2a) c752r variant |
Added to library: Sat Aug 4 13:37:25 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | N | A | D | M | E | M | T | L | E | R | A | V | S | M | L | E | A | D | H | M | L | P | S | R | I | S | A | A | A | T | F | I | Q | H | E | C | F | Q | K | S | E | A | R | K | R | V | N | Q | L | R | G | I | L | K | L | L | Q | L | L | K | V | Q | N | E | D | V | Q | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | C | G | A | L | R | N | L | V | F | E | D | N | D | N | K | L | E | V | A | E | L | N | G | V | P | R | L | L | Q | V | L | K | Q | T | R | D | L | E | T | K | K | Q | I | T | G | L | L | W | N | L | S | S | N | D | K | L | K | N | L | M | I | T | E | A | L | L | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | E | N | I | I | I | P | F | S | G | W | P | E | G | D | Y | P | K | A | N | G | L | L | D | F | D | I | F | Y | N | V | T | G | C | L | R | N | M | S | S | A | G | A | D | G | R | K | A | M | R | R | C | D | G | L | I | D | S | L | V | H | Y | V | R | G | T | I | A | D | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | T | S | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | P | D | D | K | A | T | E | N | C | V | C | I | L | H | N | L | S | Y | Q | L | E | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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