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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3tcaA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: amyloid beta a4 precursor protein-binding family b member | PDBTitle: crystal structure of the ras-associating and pleckstrin-homology2 domains of riam |
Added to library: Sat Sep 29 15:14:58 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | K | K | L | V | V | K | V | H | M | D | D | S | S | T | K | S | L | M | V | D | E | R | Q | L | A | R | D | V | L | D | N | L | F | E | K | T | H | C | D | C | N | V | D | W | C | L | Y | E | I | Y | P | E | L | Q | I | E | R | V | F | E | D | H | E | N | V | V | E | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | D | W | T | R | D | T | E | N | K | V | L | F | L | E | K | E | E | R | Y | A | V | F | K | N | P | Q | N | F | Y | L | M | N | A | K | N | K | E | Y | L | L | E | E | S | F | C | G | T | S | I | I | V | P | E | L | E | G | A | L | Y | L | K | E | D | G | K | K | S | W | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | Y | F | L | L | R | A | S | G | I | Y | Y | V | P | K | G | K | T | K | T | S | R | D | L | A | C | F | I | Q | F | E | N | V | N | I | Y | Y | G | I | Q | C | K | M | K | Y | K | A | P | T | D | H | C | F | V | L | K | H | P | Q | I | Q | K | E | S | Q | Y | I | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | L | C | C | D | D | A | R | T | L | S | Q | W | V | M | G | I | R | I | A | K | Y | G | K | T | L | Y | D | N | Y | Q | R | A | V | A | R | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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