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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3tbiB_ | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase subunit beta; | PDBTitle: crystal structure of t4 gp33 bound to e. coli rnap beta-flap domain |
Added to library: Sat Nov 26 19:47:22 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | I | H | I | Q | E | L | A | C | V | S | R | D | T | K | L | G | P | E | E | I | T | A | D | I | P | N | V | G | E | A | A | L | S | K | L | D | E | S | G | I | V | Y | I | G | A | E | V | T | G | G | D | I | L | V | G | K | V | T | P | K | G | E | T | Q | L | T | P | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | B | T | T | S | B | B | T | T | B | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | L | R | A | I | F | G | E | K | A | S | D | V | K | D | S | S | L | R | V | P | N | G | V | S | G | T | V | I | D | V | Q | V | F | T | R | D | G | V | E | K | D | K | R | A | L | E | I | E | E | X | Q | L | K | Q | A | K | K | D | L | S | E | E | L | Q | I | L | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | L | F | S | R | I | R | A | V | L | V | A | G | G | V | E | A | E | K | L | D | K | L | P | R | D | R | W | L | E | L | G | L | T | D | E | E | K | Q | N | Q | L | E | Q | L | A | E | Q | Y | D | E | L | K | H | E | F | E | K | K | L | E | A | K | R | R | K | I | T | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | D | L | A | P | G | V | L | K | I | V | K | V | Y | L | A | V | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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