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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3tacA_ | PDB header: transferase/protein binding | Chain: A: PDB Molecule: peripheral plasma membrane protein cask; | PDBTitle: crystal structure of the liprin-alpha/cask complex |
Added to library: Wed Jan 9 16:52:38 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | S | S | G | L | V | P | S | M | A | D | D | D | V | L | F | E | D | V | Y | E | L | C | E | V | I | G | K | G | P | F | S | V | V | R | R | C | I | N | R | E | T | G | Q | Q | F | A | V | K | I | V | D | V | A | K | F | T | S | S | P | G | L | S | T | E | D | L | K | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | I | C | H | M | L | K | H | P | H | I | V | E | L | L | E | T | Y | S | S | D | G | M | L | Y | M | V | F | E | F | M | D | G | A | D | L | C | F | E | I | V | K | R | A | D | A | G | F | V | Y | S | E | A | V | A | S | H | Y | M | R | Q | I | L | E | A | L | R | Y | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | D | N | N | I | I | H | R | D | V | K | P | H | C | V | L | L | A | S | K | E | N | S | A | P | V | K | L | G | G | F | G | V | A | I | Q | L | G | E | S | G | L | V | A | G | G | R | V | G | T | P | H | F | M | A | P | E | V | V | K | R | E | P | Y | G | K | P | V | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | B | S | G | G | G | T | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | W | G | C | G | V | I | L | F | I | L | L | S | G | C | L | P | F | Y | G | T | K | E | R | L | F | E | G | I | I | K | G | K | Y | K | M | N | P | R | Q | W | S | H | I | S | E | S | A | K | D | L | V | R | R | M | L | M | L | D | P | A | E | R | I | T | V | Y | E | A | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | S | S | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | |||||||
Sequence | H | P | W | L | K | E | R | D | R | Y | A | Y | K | I | H | L | P | E | T | V | E | Q | L | R | K | F | N | A | R | R | K | L | K | G | A | V | L | A | A | V | S | S | H | K | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | T | S | T | T | T | T | T |
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