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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3t7hB_ | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: ubiquitin-like modifier-activating enzyme atg7; | PDBTitle: atg8 transfer from atg7 to atg3: a distinctive e1-e2 architecture and2 mechanism in the autophagy pathway |
Added to library: Sat Nov 26 19:47:38 2011 | |
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Sequence | G | S | M | S | S | E | R | V | L | S | Y | A | P | A | F | K | S | F | L | D | T | S | F | F | Q | E | L | S | R | L | K | L | D | V | L | K | L | D | S | T | C | Q | P | L | T | V | N | L | D | L | H | N | I | P | K | S | A | D | Q | V | P | L | F | L | T | N | R | S | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | B | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | H | N | N | K | R | T | N | E | V | P | L | Q | G | S | I | F | N | F | N | V | L | D | E | F | K | N | L | D | K | Q | L | F | L | H | Q | R | A | L | E | C | W | E | D | G | I | K | D | I | N | K | C | V | S | F | V | I | I | S | F | A | D | L | K | K | Y | R | F | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | W | L | G | V | P | C | F | Q | R | P | S | S | T | V | L | H | V | R | P | E | P | S | L | K | G | L | F | S | K | C | Q | K | W | F | D | V | N | Y | S | K | W | V | C | I | L | D | A | D | D | E | I | V | N | Y | D | K | C | I | I | R | K | T | K | V | L | A | I | R | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | T | M | E | N | V | P | S | A | L | T | K | N | F | L | S | V | L | Q | Y | D | V | P | D | L | I | D | F | K | L | L | I | I | R | Q | N | E | G | S | F | A | L | N | A | T | F | A | S | I | D | S | S | S | N | P | D | M | K | V | S | G | W | E | R | N | V | Q | G | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | D | R | V | V | D | L | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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