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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3t06E_ | PDB header: signaling protein | Chain: E: PDB Molecule: rho guanine nucleotide exchange factor 11; | PDBTitle: crystal structure of the dh/ph fragment of pdzrhogef with n-terminal2 regulatory elements in complex with human rhoa |
Added to library: Sat Aug 6 10:04:19 2011 | |
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Sequence | Q | N | W | Q | H | T | V | G | K | D | V | V | A | G | L | T | Q | R | E | I | D | R | Q | E | V | I | N | E | L | F | V | T | E | A | S | H | L | R | T | L | R | V | L | D | L | I | F | Y | Q | R | M | K | K | E | N | L | M | P | R | E | E | L | A | R | L | F | P | N | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | I | E | I | H | N | S | W | C | E | A | M | K | K | L | R | E | E | G | P | I | I | K | E | I | S | D | L | M | L | A | R | F | D | G | P | A | R | E | E | L | Q | Q | V | A | A | Q | F | C | S | Y | Q | S | I | A | L | E | L | I | K | T | K | Q | R | K | E | S | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | L | F | M | Q | E | A | E | S | H | P | Q | C | R | R | L | Q | L | R | D | L | I | I | S | E | M | Q | R | L | T | K | Y | P | L | L | L | E | S | I | I | K | H | T | E | G | G | T | S | E | H | E | K | L | C | R | A | R | D | Q | C | R | E | I | L | K | Y | V | N | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | Q | T | E | N | R | H | R | L | E | G | Y | Q | K | R | L | D | A | T | A | L | E | R | A | S | N | P | L | A | A | E | F | K | S | L | D | L | T | T | R | K | M | I | H | E | G | P | L | T | W | R | I | S | K | D | K | T | L | D | L | H | V | L | L | L | E | D | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | V | L | L | Q | K | Q | D | E | K | L | L | L | K | C | H | S | K | T | F | S | P | V | L | K | L | N | A | V | L | I | R | S | V | A | T | D | K | R | A | F | F | I | I | C | T | S | K | L | G | P | P | Q | I | Y | E | L | V | A | L | T | S | S | D | K | N | T | W | M | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | B | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | E | E | A | V | R | N | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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