|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3swhA_ | PDB header: exocytosis | Chain: A: PDB Molecule: protein unc-13 homolog a; | PDBTitle: munc13-1, mun domain, c-terminal module |
Added to library: Sat Nov 5 19:10:47 2011 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | W | F | E | P | F | V | I | Q | W | L | D | E | N | E | E | V | S | R | D | F | L | H | G | A | L | E | R | D | K | K | D | G | F | Q | Q | T | S | E | H | A | L | F | S | C | S | V | V | D | V | F | S | Q | L | N | Q | S | F | E | I | I | K | K | L | E | C | P | D | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | G | H | Y | M | R | R | F | A | K | T | I | S | N | V | L | L | Q | Y | A | D | I | V | S | K | D | F | A | S | Y | C | S | K | E | K | E | K | V | P | C | I | L | M | N | N | T | Q | Q | L | R | V | Q | L | E | K | M | F | E | A | M | G | G | K | E | L | D | A | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | G | T | L | K | E | L | Q | V | K | L | N | N | V | L | D | E | L | S | H | V | F | A | T | S | F | Q | P | H | I | E | E | C | V | R | Q | M | G | D | I | L | S | Q | V | K | S | V | A | Q | D | A | D | N | V | L | Q | P | I | M | D | L | L | D | S | N | L | T | L | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | I | C | E | K | T | V | L | K | R | V | L | K | E | L | W | K | L | V | M | N | T | M | E | R | T | I | V | L | P | P | E | F | S | K | L | K | D | H | P | K | Q | C | A | V | V | E | L | A | L | D | T | I | K | Q | Y | F | H | A | G | G | V | G | L | K | K | T | F | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | S | P | D | L | Q | S | L | R | Y | A | L | S | L | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|