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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3sv1C_ | PDB header: protein binding | Chain: C: PDB Molecule: amyloid beta a4 precursor protein-binding family a member | PDBTitle: crystal structure of app peptide bound rat mint2 parm |
Added to library: Sat Jul 14 13:19:35 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | E | D | L | I | D | G | I | I | F | A | A | N | Y | L | G | S | T | Q | L | L | S | E | R | N | P | S | K | N | I | R | M | M | Q | A | Q | E | A | V | S | R | V | K | R | M | Q | K | A | A | K | I | K | K | K | A | N | Q | T | L | T | E | V | D | L | F | I | S | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | I | K | V | L | N | A | D | T | Q | E | T | M | M | D | H | A | L | R | T | I | S | Y | I | A | D | I | G | N | I | V | V | L | M | A | R | R | K | Q | Y | K | M | I | C | H | V | F | E | S | E | D | A | Q | L | I | A | Q | S | I | G | Q | A | F | S | V | A | Y | Q | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | R | A | I | N | P | E | D | L | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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