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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3suzA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: amyloid beta a4 precursor protein-binding family a member | PDBTitle: crystal structure of rat mint2 ppc |
Added to library: Sat Jul 14 13:24:43 2012 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | E | D | L | I | D | G | I | I | F | A | A | N | Y | L | G | S | T | Q | L | L | S | E | R | N | P | S | K | N | I | R | M | M | Q | A | Q | E | A | V | S | R | V | K | R | M | Q | K | A | A | K | I | K | K | K | A | N | S | E | G | D | A | Q | T | L | T | E | V | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | I | S | T | Q | R | I | K | V | L | N | A | D | T | Q | E | T | M | M | D | H | A | L | R | T | I | S | Y | I | A | D | I | G | N | I | V | V | L | M | A | R | R | R | M | P | R | S | A | G | K | K | Q | Y | K | M | I | C | H | V | F | E | S | E | D | A | Q | L | I | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | I | G | Q | A | F | S | V | A | Y | Q | E | F | L | R | A | N | G | I | N | P | E | D | L | S | Q | K | E | Y | S | D | I | I | N | T | Q | E | M | Y | N | D | D | L | I | H | F | S | N | S | E | N | C | K | E | L | Q | L | E | K | H | K | G | E | I | L | G | V | V | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | S | S | I | L | P | T | V | I | L | A | N | M | M | N | G | G | P | A | A | R | S | G | K | L | S | I | G | D | Q | I | M | S | I | N | G | T | S | L | V | G | L | P | L | A | T | C | Q | G | I | I | K | G | L | K | N | Q | T | Q | V | K | L | N | I | V | S | C | P | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | E | T | P | L | Y | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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