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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3sibA_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: ure3-bp sequence specific dna binding protein; | PDBTitle: crystal structure of ure3-binding protein, wild-type |
Added to library: Mon Jul 4 03:56:16 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | N | F | C | L | W | N | L | Q | P | I | M | P | P | S | V | R | N | T | W | W | F | P | L | L | N | T | I | P | L | D | Q | Y | T | R | I | Y | Q | W | F | M | G | V | D | R | D | R | S | G | T | L | E | I | N | E | L | M | M | G | Q | F | P | G | G | I | R | L | S | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | L | R | M | M | R | I | F | D | T | D | F | N | G | H | I | S | F | Y | E | F | M | A | M | Y | K | F | M | E | L | A | Y | N | L | F | V | M | N | D | R | N | R | S | G | T | L | E | P | H | E | I | L | P | A | L | Q | Q | L | G | F | Y | I | N | Q | R | T | S | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | L | H | R | L | F | A | R | G | M | A | F | C | D | L | N | C | W | I | A | I | C | A | F | A | A | Q | T | R | S | A | Y | Q | M | I | F | M | N | P | Y | Y | G | P | M | K | P | F | N | P | M | E | F | G | K | F | L | D | V | V | T | S | L | L | E | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | S | G | G | G | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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