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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3sb4B_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: hypothetical leucine rich repeat protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical leucine rich repeat protein2 (bt_1240) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.99 a3 resolution |
Added to library: Sun Jun 26 11:33:37 2011 | |
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Sequence | Q | V | S | K | T | Y | Y | V | S | K | P | G | T | L | I | S | X | X | T | E | E | E | A | N | S | I | T | H | L | T | L | T | G | K | L | N | A | E | D | F | R | H | L | R | D | E | F | P | S | L | K | V | L | D | I | S | N | A | E | I | K | X | Y | S | G | K | A | G | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | N | G | K | F | Y | I | Y | X | A | N | F | V | P | A | Y | A | F | S | N | V | V | N | G | V | T | K | G | K | Q | T | L | E | K | V | I | L | S | E | K | I | K | N | I | E | D | A | A | F | K | G | C | D | N | L | K | I | C | Q | I | R | K | K | T | A | P | N | L | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | A | L | A | D | S | V | T | A | I | F | I | P | L | G | S | S | D | A | Y | R | F | K | N | R | W | E | H | F | A | F | I | E | G | E | P | L | E | T | T | I | Q | V | G | A | X | G | K | L | E | D | E | I | X | K | A | G | L | Q | P | R | D | I | N | F | L | T | I | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | L | D | N | A | D | F | K | L | I | R | D | Y | X | P | N | L | V | S | L | D | I | S | K | T | N | A | T | T | I | P | D | F | T | F | A | Q | K | K | Y | L | L | K | I | K | L | P | H | N | L | K | T | I | G | Q | R | V | F | S | N | C | G | R | L | A | G | T | L | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | A | S | V | T | A | I | E | F | G | A | F | X | G | C | D | N | L | R | Y | V | L | A | T | G | D | K | I | T | T | L | G | D | E | L | F | G | N | G | V | P | S | K | L | I | Y | K | K | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |
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