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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3rw6A_ | PDB header: transport protein/rna | Chain: A: PDB Molecule: nuclear rna export factor 1; | PDBTitle: structure of nuclear rna export factor tap bound to cte rna |
Added to library: Wed Jan 9 23:14:54 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | W | F | K | I | T | I | P | Y | G | R | K | Y | D | K | A | W | L | L | S | M | I | Q | S | K | C | S | V | P | F | T | P | I | E | F | H | Y | E | N | T | R | A | Q | F | F | V | E | D | A | S | T | A | S | A | L | K | A | V | N | Y | K | I | L | D | R | E | N | R | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | I | I | I | N | S | S | A | P | P | H | T | I | L | N | E | L | K | P | E | Q | V | E | Q | L | K | L | I | M | S | K | R | Y | D | G | S | Q | Q | A | L | D | L | K | G | L | R | S | D | P | D | L | V | A | Q | N | I | D | V | V | L | N | R | R | S | C | M | A | A | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | I | I | E | E | N | I | P | E | L | L | S | L | N | L | S | N | N | R | L | Y | R | L | D | D | M | S | S | I | V | Q | K | A | P | N | L | K | I | L | N | L | S | G | N | E | L | K | S | E | R | E | L | D | K | I | K | G | L | K | L | E | E | L | W | L | D | G | N | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | |
Sequence | C | D | T | F | R | D | Q | S | T | Y | I | S | A | I | R | E | R | F | P | K | L | L | R | L | D | G | H | E | L | P | P | P | I | A | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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